Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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