Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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