Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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