Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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