Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1B1Q10567 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms