Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms