Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP1Q09161 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms