Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms