Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms