Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms