Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARDQ03181 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms