Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms