Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms