Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms