Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms