Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF3P61204 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms