Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH11P55287 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH11P55287 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH11P55287 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH11P55287 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH11P55287 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH11P55287 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH11P55287 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms