Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRPF1P55201 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRPF1P55201 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRPF1P55201 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.33■■□□□ 1
BRPF1P55201 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BRPF1P55201 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms