Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms