Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms