Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms