Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MVDP53602 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MVDP53602 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MVDP53602 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MVDP53602 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms