Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms