Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DAP3P51398 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DAP3P51398 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms