Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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