Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms