Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms