Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPARGP37231 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPARGP37231 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGP37231 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms