Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms