Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRBP28702 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRBP28702 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRBP28702 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRBP28702 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRBP28702 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRBP28702 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRBP28702 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRBP28702 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRBP28702 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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