Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms