Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms