Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPI1P17947 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms