Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA6P17658 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA6P17658 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms