Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD46P15529 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD46P15529 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD46P15529 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD46P15529 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD46P15529 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CD46P15529 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD46P15529 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms