Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRCP08575 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRCP08575 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPRCP08575 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRCP08575 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRCP08575 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRCP08575 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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