Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBP07199 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBP07199 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBP07199 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBP07199 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms