Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms