Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms