Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB5O95377 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB5O95377 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB5O95377 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB5O95377 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB5O95377 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms