Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOFO60613 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOFO60613 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOFO60613 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms