Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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