Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms