Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNMO15061 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNMO15061 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms