Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1AO15047 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms