Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms