Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms