Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms