Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms