Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP5A6NIR3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms